Медреестр. На главную страницу

Главная » Статьи » Изучение ДНК неандертальцев у современных людей с использованием стволовых клеток и органоидов

Изучение ДНК неандертальцев у современных людей с использованием стволовых клеток и органоидов

Протоколы, которые позволяют трансформировать линии индуцированных человеком плюрипотентных стволовых клеток (iPSC) в органоиды, изменили способ, которым ученые могут изучать процессы развития и позволяют им расшифровывать взаимодействие между генами и формированием ткани, особенно для органов, где первичная ткань недоступна. Теперь исследователи берут эту технологию и применяют ее для изучения влияния ДНК неандертальца на развитие. О выводах сообщают 18 июня в журнале Stem Cell Reports, по информации сайта ascania-nova.org.

«Использование линий iPSC для изучения функций архаичной человеческой ДНК - неиспользованный, но очень интересный подход», - говорит старший автор J. Grey Camp из Института эволюционной антропологии Макса Планка в Германии и Университета Базеля в Швейцарии. «Никто никогда не мог взглянуть на роль ДНК неандертальца во время развития».

Исследования показали, что около 2% геномов современных людей за пределами Африки состоят из ДНК неандертальцев. Эта архаичная ДНК является результатом спаривания между двумя группами десятки тысяч лет назад.

В новом исследовании команда использовала ресурсы от Инициативы плюрипотентных стволовых клеток человека (HipSci), международного консорциума, который предоставляет данные и клеточные линии для исследования. Почти все данные и клеточные линии в HipSci от людей британского и североевропейского происхождения. Исследователи проанализировали этот ресурс клеточной линии на предмет содержания ДНК неандертальцев и аннотировали функциональные варианты неандертальцев для каждой из клеточных линий.

«Некоторые аллели неандертальцев имеют относительно высокую частоту в этой популяции», - объясняет Кэмп. «Из-за этого этот ресурс iPSC содержит некоторые гены, гомозиготные по аллелям неандертальца, включая гены, связанные с цветом кожи и волос, которые широко распространены у европейцев».

Команда Кэмпа использовала пять клеточных линий для генерации органоидов в мозге и генерировала данные секвенирования одноклеточной РНК для анализа их клеточного состава. Они показали, что эти транскриптомные данные могут быть использованы для отслеживания происходящей из неандертальца РНК в процессе развития. «Это исследование, доказывающее принципиальность того, что вы можете использовать эти ресурсы для изучения активности ДНК неандертальца в процессе развития», - говорит Кэмп. «Настоящей проблемой будет увеличение количества строк в одном эксперименте, но это уже становится возможным».

Кэмп отмечает, что это исследование может быть расширено для изучения других древних человеческих популяций, включая денисовцев, у которых есть гены, которые присутствуют главным образом в популяциях Океании. Его команда также планирует продолжить изучение неандертальских аллелей, используя HipSci и другие ресурсы. «Органоиды могут быть использованы для изучения ряда различных процессов развития и фенотипов, контролируемых ДНК неандертальца, включая кишечный тракт и пищеварение, познание и нервную функцию, а также иммунный ответ на патогены», - заключает он.

Исследователи создали веб-браузер с этой информацией, чтобы сделать данные легкодоступными для будущих исследований.


Предыдущая статья
Следущая статья

Вернуться
 

 

dmae, q10, dhea, биотин, 5-htp, омега купить в спб

Prof-medicina.ru

MEDREESTR.RU ©